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我國超分辨光鏡-電鏡關聯(lián)成像取得重要進展

2019年10月14日,中國科學院生物物理研究所徐濤院士課題組與徐平勇課題組合作,在《Nature Methods》上發(fā)表了題為 “mEosEM withstands osmium staining and Epon embedding for super-resolution CLEM” 的研究論文。他們發(fā)展了第一個常規(guī)電鏡制樣后保持熒光的光轉(zhuǎn)化熒光蛋白,首次實現(xiàn)了Epon后固定的同層超薄樣品的超分辨光鏡-電鏡關聯(lián)成像,極大地促進了超分辨光鏡和電鏡成像領域的發(fā)展,有望帶來生物學中的廣泛應用。


蛋白質(zhì)等分子在細胞中的特定位置組裝成蛋白質(zhì)機器進而發(fā)揮生物學功能,因此研究蛋白質(zhì)等分子在細胞中的精確定位對于揭示蛋白質(zhì)機器的組裝和分子機制至關重要。電子顯微鏡具有亞納米尺度的空間分辨率,是生命科學領域中不可缺少的研究工具。然而在電鏡圖像中定位目標蛋白具有很大的挑戰(zhàn)。例如常用的免疫電鏡利用抗原—抗體反應在電鏡圖像中標記和定位蛋白質(zhì),該方法標記效率低,而且對抗體的特異性依賴性很大。近年來出現(xiàn)的光鏡-電鏡關聯(lián)成像技術(shù)是一種雙模態(tài)成像技術(shù),該技術(shù)利用光鏡成像來定位目標分子,標記效率和特異性高,同時還可利用電鏡對細胞進行超微結(jié)構(gòu)成像。超分辨光鏡-電鏡關聯(lián)是更先進的光電關聯(lián)技術(shù),其中超分辨光鏡打破了光學衍射極限,將成像的空間分辨率提高到幾十納米。


光電關聯(lián)技術(shù)的核心難點是電鏡制樣后熒光分子無法保持熒光。當前光電關聯(lián)成像一般是先用光鏡對整個細胞成像,然后再固定和包埋電鏡制樣,導致電鏡成像中不容易找到光鏡圖像中的同一細胞,而且整體細胞的光鏡圖像與超薄切片的電鏡圖像關聯(lián)不準。常規(guī)電鏡制樣方法,包括使用1% 鋨酸固定來保持細胞的超微結(jié)構(gòu)和電鏡襯度,以及使用Epon包埋來保證樣品的切片質(zhì)量,能夠獲得高質(zhì)量的電鏡圖片,并可應用于大尺度生物樣品如腦組織的連續(xù)切片和3D重構(gòu)。因此,急需發(fā)展抗鋨酸固定和Epon包埋的熒光蛋白,在電鏡制樣的超薄切片中保持熒光,實現(xiàn)真正的光電關聯(lián)。

本研究中,團隊成員發(fā)展了第一個抗鋨酸固定和Epon包埋的熒光蛋白,該熒光蛋白在電鏡制樣后仍然保持熒光并具有光開關的活性,通過優(yōu)化超薄切片中單分子定位算法和成像方法,首次實現(xiàn)了Epon后固定電鏡樣品的同層超分辨光鏡-電鏡關聯(lián)成像。該光電關聯(lián)成像方法很好地保留了電鏡圖像中線粒體等亞細胞結(jié)構(gòu),并具有單分子定位超分辨光鏡成像的單分子定位精度。利用該技術(shù)合作團隊成功實現(xiàn)了線粒體和核膜的光電關聯(lián)成像(圖1)。該熒光蛋白將在神經(jīng)以及腦科學等需要對大尺度厚樣品進行連續(xù)切片和3D重構(gòu)的光電關聯(lián)中得到廣泛應用。

超分辨光電關聯(lián)成像結(jié)果
圖1. 線粒體基質(zhì)(a)和核纖層蛋白(b)的超分辨光電關聯(lián)成像結(jié)果


徐濤院士領銜的儀器研發(fā)團隊近年來致力于顯微成像儀器設備和技術(shù)方法的研究和開發(fā),先后研制出偏振單分子干涉成像、冷凍單分子定位成像以及超分辨光電融合成像系統(tǒng),開發(fā)了多種新的超分辨顯微成像方法。徐平勇課題組主要致力于發(fā)展多種用于超分辨成像如PALM/STORM、SOFI、SIM等的探針,并基于探針的光化學特性發(fā)展新的成像方法如貝葉斯單分子超分辨成像方法SIMBA等,來提高超分辨成像的時空分辨率。該工作是徐濤院士課題組/徐平勇課題組合作,繼PALM成像探針mEos3.2(Nature Methods,2012)、活細胞超分辨成像方法Quick-SIMBA(Nano Letter,2019)后在超分辨成像領域取得的又一重要研究成果。


徐濤院士、張名姝副研究員和徐平勇研究員為該文章的共同通訊作者,付志飛、彭鼎銘、張名姝為共同第一作者。


該工作受到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金、中科院先導專項、中科院科研儀器設備研制項目、以及北京市科技計劃等項目的資助。

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